Сушений чилі Guajillo, як й свіжий перець Mirasol, має широке застосування в мексиканській кухні, займаючи друге місце після перцю сорту Poblano (див.
Ancho Grande).
Особливу популярність Guajillo має при приготуванні ароматної сальси (соусу) для тамале (tamale) – однієї з найпопулярніших мексиканських страв: експерти налічують до 1000 різних видів тамале і вважають, що їх річне споживання перевищує сотні мільйонів одиниць.
Перець Guajillo використовують як самостійно, так й у пастах і підливах до всіх видів м'яса і птиці, особливо курки.
Крім того, цей сушений чилі додають у мексиканські сальси для створення дивного солодко-пекучого гарніру.